Několik dní před vydáním OS X El Capitan uživatelé zjistili, že Apple odstranil z Mac App Storu operační systémy Lion, Mountain Lion a Movericks. Také zmizely aplikace Aperture a iPhoto. Rozhodnutí Applu znemožnit uživatelům stahovat starší operační systémy OS X a aplikace někteří uživatelé hodnotí jako nepřátelské.
Jednalo se zřejmě o serverovou chybu, neboť aplikace i operační systémy jsou opět dostupné v Mac App Storu. Apple však nebude zastaralé produkty podporovat do nekonečna. Je možné, že se bude Apple snažit blokovat zasteralé operační systémy, protože chce aby uživatelé používali moderní OS X El Capitan, který přináší mnohá vylepšení.
