Jak se ukazuje podle dostupných zdrojů Apple.club.tw, tak nedávno představený iPhone 6s Plus má o 5% menší kapacitu baterie. Kapacita je 2.750 mAh, ale výdrž baterie je rovněž 14 hodin jako dřívější model. Pro srovnání iPhone 6 Plus má kapacitu baterie 2.915 mAh.
Velký vliv na udržení výdrže baterie je systém iOS 9, který je šetrnější k baterii, než předchozí verze iOS 8.
