Po aktualizace Pixelmatoru pro Mac, byl vydaná se stejnám nástrojem i verze pro iOS s označením 2.3, kde je nově inteligentní tzv. magnetický výběr a slouží pro rychlý výběr souvisejících pixelů kolem výběru objektu. To je nově skvěle použitelné i na dotykovém displeji iPadu popř. iPhonu.
Reakce aplikace také samozřejmě funguje v závislosti na citlivosti tlaku výběru pomocí Apple Pencilu.
Pixelmator pro iPhone a iPad lze stáhnout z App Store, cena $ 4,99. iOS aplikace také umožňuje bezproblémovou integraci s Pixelmator pro Mac ($ 29.99), k dispozici v Mac App Store.