Nový iPad mini je prvním iPadem, který je odolný vůči vodě; disponuje stupněm krytí IP67, což značí odolnost proti vodě a prachu. Apple podrobil zařízení testům ponoření do vody v hloubce až jednoho metru po dobu maximálně 30 minut, a to za kontrolovaných laboratorních podmínek.
Společnost jako příklady situací, kdy může být tato ochrana obzvláště užitečná, uvádí čtení u bazénu nebo práci venku za deště. K dosažení této odolnosti zřejmě přispívá zvukový systém, kterým je nový iPad mini vybaven. Ten využívá speciálně navržené basové měniče propojené s displejem, zatímco výškové měniče jsou skryty mezi sklem a hliníkovým tělem zařízení. Podle Applu přispívá utěsněná konstrukce systému nejen ke splnění standardu IP67, ale také zlepšuje podání basů a zvyšuje hlasitost. Apple upozorňuje, že odolnost proti postříkání, vodě a prachu není trvalá a může se v důsledku běžného opotřebení snižovat. Společnost zároveň varuje před nabíjením mokrého iPadu; na poškození způsobená kapalinami se navíc nevztahuje záruka.
