iPhone Duo bude fungovat s Apple Pencil, ale podpora je omezená. Apple uvádí, že pro iPhone Duo potřebujete Apple Pencil s USB-C portem, takže pokud máte Apple Pencil Pro, možná budete mít smůlu.
Je pravděpodobné, že iPhone Duo nepodporuje Apple Pencil Pro, protože se nabíjí magneticky, když je připojena ke kompatibilnímu iPadu, zatímco Apple Pencil s USB-C portem se nabíjí pomocí portu USB-C skrytého za posuvnou krytkou. Apple Pencil s USB-C portem nepodporuje citlivost na tlak, dvojité klepnutí, otáčení, haptickou zpětnou vazbu, stisknutí ani funkci Najít, ale má citlivost na náklon. Apple uvádí, že Apple Pencil bude fungovat s vnitřním i vnějším displejem iPhonu Duo. Je to první iPhone, který funguje s Apple Pencil. Podpora Apple Pencil nebude k dispozici hned po vydání iPhonu Duo a Apple uvádí, že dorazí později v tomto roce. iPhone Duo bude vydán 23. října a předobjednávky začnou 16. října.
