iPhone Duo se dodává s operačním systémem iOS 27.1 – verzí iOS 27 určenou výhradně pro toto skládací zařízení. Společnost Apple vydala novou verzi systému iOS 27.1 (označenou jako 24A94425), což znamená, že na uživatele bude hned po vybalení čekat aktualizace.
Apple pravděpodobně vydal tuto novou sestavu, aby opravil chyby v době, kdy zařízení testují zástupci médií. Vzhledem k tomu, že iPhone Duo vstoupí na trh až 23. října, má Apple dostatek času na vydání další aktualizace iOS 27.1, nebo dokonce verze iOS 27.2. Je možné, že aktualizace 24A94425 nakonec nebude k dispozici, protože ji mezitím nahradí novější verze; v každém případě však bude během úvodního nastavování iPhonu Duo nutné provést aktualizaci systému.
