Apple Watch Series 9 a Apple Watch Ultra 2 obsahují 64GB úložiště, což je dvojnásobek oproti předchozím generacím. Jak je uvedeno na stránce specifikací společnosti Apple všechny modely mají dvakrát větší úložiště než jejich předchůdci.
Navýšení nabízí podstatně více prostoru pro aplikace a média a pravděpodobně souvisí se zcela novým čipem S9, který přináší výrazné zlepšení výkonu a efektivity. Apple Watch, Apple Watch Series 2 a Apple Watch Series 3 měly pouze 8 GB úložiště, který se u Apple Watch Series 4 zvýšil na 16 GB. Apple Watch Series 5 navýšily úložiště ještě jednou na 32 GB, kde zůstalo až do Apple Watch 6, Apple Watch Series 7 a Apple Watch Series 8, díky čemuž je to poprvé, kdy Apple navýšil úložiště zařízení za pět let. Stojí za zmínku, že pouze část úložiště Apple Watch je k dispozici pro média, jako je hudba a podcasty, protože Apple jej omezuje na 25 % celkového úložiště zařízení.
