Zdá se, že Apple Music vyvolává u některých uživatelů vážné obavy o ochranu soukromí, protože na Redditu je několik stížností, že se náhodně objevují seznamy skladeb jiných lidí v hudebních knihovnách v aplikaci Hudba.
Redditor adh1003, který ohledně problému kontaktoval MacRumors, sestavil několik zpráv od uživatelů, kteří si stěžovali na výskyt podivných seznamů skladeb v aplikaci, které neznají. MacRumors od té doby našel na Redditu další příspěvky od uživatelů, kteří hlásili stejné chování. V některých případech byly neznámé seznamy skladeb sloučeny se stávajícími seznamy skladeb uživatelů. V jiných případech seznamy skladeb uživatelů zmizely nebo byly nahrazeny neznámými. Někteří uživatelé vyjádřili obavy, že jejich účty byly hacknuty, ale pravděpodobnější příčinou problému je blíže nespecifikovaný problém se serverem iCloud společnosti Apple. Zrušení synchronizace a následné opětovné synchronizování iCloudu pro aplikaci Hudba (Nastavení -> Apple ID -> iCloud -> Zobrazit vše) fungovalo u několika uživatelů, ale ne u všech.
